जननांग मस्से ह्यूमन पेपिलोमावायरस (HPV) (human papillomavirus) के कारण होते हैं। अभी तक 100 से अधिक HPV प्रकार के वायरस की पहचान की गई है, इनमें से 40 प्रकार के वायरस में जननांग क्षेत्र को संक्रमित करने की क्षमता पाई जाती है।

एचपीवी (HPV) वायरस त्वचा संपर्क के माध्यम से एक व्यक्ति से दूसरे व्यक्ति तक अत्यधिक तेजी से संक्रमित हो सकता है। यही कारण है कि इसे यौन संक्रमित बीमारी (STI) माना जाता है। सामान्यता HPV वायरस हमेशा जननांग मस्सों (Genital Warts) की जटिलताओं का कारण नहीं बनता है। ज्यादातर मामलों में, यह वायरस बिना किसी स्वास्थ्य समस्या के नष्ट हो जाता है या दूर हो जाता है।

इसके अतिरिक्त असुरक्षित यौन संबंध बनाने से भी जननांग मस्सों की बीमारी को ग्रहण किया जा सकता है।

जननांग मस्सों (Genital Warts) के अप्रत्यक्ष रूप से होने के कारणों में शामिल हैं:

किसी भी प्रोटेक्शन (barrier protection) के उपयोग के बिना यौन संपर्क बनाने के कारण
जन्म नियंत्रण गोलियाँ लेने से
एक से अधिक यौन भागीदारों के कारण
कम उम्र में यौन संबंध बनाने से